מזכיר האיגוד/החברה ייבחר על ידי הוועד ומבין חבריו ברוב קולות.
מתפקידו לדאוג לעריכת פרוטוקולים של ישיבות הוועד, לבצע את ההתכתבויות של האיגוד/החברה, לדאוג לרשימה מעודכנת של החברים וכתובותיהם, וכמו כן עליו להודיע לחברים על פגישות, אסיפות ותכניות. סמכויותיו ותפקידיו מפורטים בסעיף 368 לתקנון.
בהיעדר המזכיר, ימלא את מקומו היו"ר או הגזבר.