לשר"פ יתרונות רבים וחשובים שעל חלקם עמדה כבר ועדת נתניהו17 ואת חלקם נביא בנוסף להלן:
- השר"פ מאפשר ניצול יעיל של המשאבים ושל הציוד הרפואי היקר מעבר לשעות העבודה המקובלות. התשלום הניתן במסגרת הטיפול מאפשר החזרה יעילה יותר של עלות ההון והפחת שלא היה מנוצל אחרת.
- השר"פ חוסך כפילות מיותרת בהוצאות הנדרשות עבור ציוד ומשאבים ובכך מייעל מאוד את עבודת המערכת. יצוין כי כבר היום קיימת טענה בקרב פקידי משרד האוצר, כי המערכת אינה יעילה וכי יש עודף של ציוד רפואי שאיננו מנוצל במלוא התפוקה. הפרדת הרפואה הפרטית מן הרפואה הציבורית עשויה להגביר מגמת הניצול היעיל.
- חלק מכספי השר"פ מופנים לטובת השקעה בתשתיות18 ובגורם האנושי19. השקעה זו מופנית לטובת כלל המטופלים, הן הבאים מקרב הרפואה הציבורית והן מקרב הרפואה הפרטית.
- נושא המחקר והפיתוח (מו"פ) איננו מטופל כלל על ידי חוק ביטוח בריאות ממלכתי. השר"פ במתכונתו הנוכחית בנוי באופן שבו שיעור קבוע מופרש לטובת מו"פ20.
- העובדה שהשר"פ מיושם במסגרת ציבורית מונע את התופעה המקובלת במסגרת הרפואה הפרטית והמאופיינת בבחירה סלקטיבית של הטיפולים הרווחיים והפחות מסוכנים בלבד.
- שר"פ במתכונת הנוכחית מגביר את הפיקוח על הרפואה הפרטית ויש אפשרות להיעזר במערכת התמיכה של בי"ח.
- הטיפול שניתן במסגרת בית החולים הציבורי מאפשר לשתף את המתמחים והסטודנטים בטיפול הניתן ובלימוד המקרה.
- השר"פ מרחיב את מסגרת שעות העבודה של הרופאים המועסקים במסגרתו באופן שבו הרופאים נשארים לאחר שעות העבודה במתחם בית החולים. בכך הם יכולים לתת מענה אד-הוק לבעיות העולות לאחר שעות העבודה, ובפועל הם הופכים זמינים באופן מיידי במידה שהם נדרשים.
- ביצוע השר"פ במתכונתו הנוכחית מאפשר לחלק ניכר מהרופאים להשלים את ההכנסה הבלתי מספקת שמתקבלת במסגרת בתי החולים שבהם הם מועסקים, מבלי "לנדוד" בין מספר מקומות עבודה. זאת ועוד, גם חלק ניכר מהרופאים שאינם מורשים לעסוק בשר"פ מקבלים חלק מכספי השר"פ בתוקף תפקידם כעוזרים במתן הטיפול ביחד עם רופאי השר"פ.
- הסדר השר"פ יכול למנוע את נשירת הרופאים הבכירים ממערכת הבריאות הציבורית לטובת עבודה מלאה במערכת הרפואה הפרטית.