44. הוועידה קובעת, כי הר"י היא הגוף המקצועי והמדעי היחיד המייצג את הרופאים בישראל. לפיכך, על משרד הבריאות וקופות החולים לשתף את ההסתדרות הרפואית ואיגודיה בקביעת מדיניות הבריאות ובביצועה, אף מעבר לחובת ההתייעצות שנקבעה בחוק. הוועידה קוראת לוועד המרכזי ליטול תפקיד מוביל בקביעת מדיניות הבריאות, ולפעול להעלאת נושא הבריאות לראש סדר העדיפויות הלאומי.
45. הוועידה קובעת, כי הר"י ואיגודיה המדעיים, בהיותם גופים מקצועיים, נבחרים ובלתי תלויים, מייצגים נאמנה את האינטרסים של ציבור המטופלים והרופאים. משום כך, הם הסמכות הקובעת את תורת העבודה הקלינית-מקצועית.
46. הוועידה קוראת להר''י להמשיך ולחזק את איגודיה ואת החברות המדעיות שלה.
47. הוועידה קובעת, כי חבר באיגוד מדעי המכהן במועצה לאומית חייב לייצג את האיגוד, ואינו רשאי להביע עמדה המנוגדת למדיניות האיגוד או למדיניות הר"י.
48. הוועידה קובעת, כי יש צורך בתקופת צינון בת שנה, לפחות, בין סיום תפקידו של נבחר באיגוד לבין קבלת תפקיד במועצה לאומית.
49. הוועידה קובעת, כי מאחר שהר"י מורכבת מגופים וממגזרים רבים, טמון חוסנה בעובדה שהיא מייצגת את כלל הרופאים בישראל, על מגוון צורות העסקתם והאינטרסים שלהם. הוועידה קוראת להמשך האחדות ושיתוף הפעולה ההדוק בין כל הגופים והמגזרים שבהר"י, כדי להגשים את מטרותיה לתועלת כלל הרופאים.
50. הוועידה קובעת, כי פעילותם של נבחרי הר''י, נבחרי הארגונים ונבחרי האיגודים המדעיים חיונית לשמירה על איכות הרפואה ולקידומה. לפיכך, יש לאפשר לכל בעלי התפקידים הללו להיעדר בתשלום מעבודתם לצורך מילוי תפקידם הציבורי. הוועידה קובעת, כי על המעסיקים להימנע מהערמת קשיים בדרך למימוש זכות זו, בהתאם להסדרים הקיבוציים.
51. הוועידה קוראת לוועד המרכזי לחזק את התקשורת הפנים-ארגונית בהר"י בכל אמצעי תקשורת הפנים המופעלים על-ידו - אתר האינטרנט, דואר אלקטרוני ועיתוני הר"י – ולהביא לידיעתם של כל חברי ההסתדרות הרפואית את כל הפעילויות של הר"י, על ארגוניה, איגודיה והחברות המדעיות שלה.