המלצות הוועדה מביעות חשש, כי עידוד המחקר בבית החולים יפגע בטיפול השוטף בחולים או כי קידום מחקר יישומיי ייעשה על חשבון מחקר בסיסי הנערך כשגרה בבית החולים. הנחה זו בטעות יסודה מהטעמים הבאים:
- לא ניתן ולא נכון, מבחינה מהותית, להפריד בין העבודה הטיפולית של הרופא לבין עבודתו המחקרית. פעילותו המחקרית של הרופא הינה חשובה לאין ערוך.
- לא ניתן להפריד בין מחקר בסיסי לבין מחקר יישומי. הפרדה זו הינה אנרכרוניסטית, איננה נכונה ואיננה ישימה. יתרה מכך, מחקר יישומי יכול ויהיה שזור בתוך הטיפול הרפואי של הרופא ומתפתח כתוצאה מאינטראקציה של הרופא עם מטופליו.