האיגוד להמטולוגיה ואונקולוגיה של ילדים מכשיר את הרופאים העוסקים בטיפול בילדים עם מחלות המטולוגיות ואונקולוגיות שפירות וממאירות כולל ילדים המטופלים בהשתלת מח עצם.
האיגוד קבע תכנית התמחות בת שנתיים וחצי שמטרתה הכשרה בהמטולוגיה-אונקולוגיה והשתלת מח עצם בילדים. תכנית זו היא התמחות על המיועדת להכשיר מומחים ברפואת ילדים בטיפול בילדים עם מחלות דם ומחלות ממאירות, כולל השתלת מח עצם בילדים ובמתבגרים (דהיינו עד גיל 18).