בית הדין של הר"י דן בסכסוכים שבין מוסד הר"י לבין חבר או בסכסוכים שבין מוסד למוסד בהר"י. עוד דן בית הדין בסכסוכים או בהאשמות בעלי אופי אישי מצד חבר הר"י נגד עמיתו, העומדים בזיקה למקצוע הרפואה, ובסכסוכים שבין חברי הר"י לבין מוסדות ואנשים שמחוצה לה והעומדים בזיקה למקצוע הרפואה.
לבית הדין בתקנון הר"י
בית הדין של הר"י שנבחר בוועידת הר"י ה-44 (מרס 2023):
יו"ר בית הדין:
ד"ר קרני תמי, אר"מ – בי"ח שמיר
חברי בית הדין – 18 חברים
- ד"ר אלתרמן מיכאל, הדסה
- ד"ר בנבוראום פאול, לאומית
- ד"ר גלעד עדי, ארק"ח קהילה – מחוז ת"א
- פרופ' גרוסמן אהוד, אר"מ – בי"ח שיבא
- ד"ר דקל רז, אר"מ – משרד הבטחון
- פרופ' הדני משה, אר"מ -גמלאי
- פרופ' ויסבוך אדי, ארק"ח בתי"ח – בי"ח קפלן
- ד"ר כץ קונסטנטין, לאומית
- ד"ר לדרר ג'פרי, ארק"ח קהילה – מחוז שו"ש
- פרופ' מוזס אלון, הדסה
- ד"ר משיח ערן, ארק"ח בתי"ח – בי"ח שניידר
- ד"ר נבון דן, ארק"ח קהילה – מחוז חיפה
- פרופ סלעי משה, איכילוב
- פרופ' פורת ראובן, איכילוב
- ד"ר פרסמן אשר, ארק"ח בתי"ח – בי"ח העמק
- פרופ' פרת גדעון, אר"מ – בי"ח שיבא
- ד"ר שפיגלמן ארסן, ארק"ח בתי"ח – בי"ח כרמל
- ד"ר תשובה יצחק, ארק"ח קהילה – ש.ל.ה.